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舆论摘要:五种螽蟖线粒体基因组的测定与直翅目谱系基因组学领会

免费论文3年前 (2022-03-24)舆论摘要60

经过L-PCR贯串二次嵌套PCR本领对5种螽蟖总科虫豸的线粒体基因组举行全序列测定,并共同NCBI中收录的和本接洽小组其余分子所测定的直翅目虫豸线粒体基因组全序列,接洽了直翅目重要类群之间的体例发育联系。赢得的重要截止如次:1.       5种螽蟖总科虫豸,辨别为疑钩额螽(Ruspolia dubia)、斑翅草螽(Conocephalus maculates)、优美蝈螽(Gampsocleis gratiosa)、朔方棘螽(Deracantha onos)和陈氏掩耳螽(Elimaea cheni),与其它已公布的螽亚目虫豸的线粒体基因组,如:东方蛞蝼(Gryllotalpa orientalis)和摩门螽蟖(Anabrus simplex)具有沟通的基因步骤。即其trnK和trnD的对立场所与已通讯蝗亚目虫豸欧洲土蝗(Locusta migratoria migratoiodes)、短额负蝗(Atractomorpha sinensis)和中华稻蝗(Oxya chinensis)差异,这表白trnK和trnD转位大概仅是蝗亚目虫豸的线粒体基因组基因排序特性。2.       斑翅草螽线粒体基因组中,除A+T充分区除外,在trnSUCN和nad1,nad1和trnLCUN之间辨别生存长度为78 bp和354 bp的基因间隙序列。3.       疑钩额螽线粒体基因组的A+T充分区长度仅70 bp,是暂时已通讯的六足众生最短的A+T充分区。4.       疑钩额螽和陈氏掩耳螽线粒体基因组的cox1均以常见的TTA动作开始暗号子。5.       5种螽蟖线粒体基因组的nad5均以不实足的中断暗号子T动作中断旗号。6.       线粒体基因组中同义暗号子的运用与暗号子第三位点的碱基构成精细关系,而与基因组所源代码的tRNA反暗号子配合情景联系不大,常常,暗号后辈三位点为A/T的暗号子运用频次高于G/C的暗号子。7.       5种螽蟖线粒体基因组的tRNA二级构造均生存确定数目的碱基错配,且均以G-U弱配对为主,这大概表示在线粒体基因组中G-U配对是一种平常的配对情势。8.       陈氏掩耳螽线粒体基因组中,A+T充分区的A+T含量为70.6%,这一数值在基因组的各个组分中最低;在疑钩额螽和优美蝈螽中,A+T充分区的A+T含量(71.4%和67.4%)也仅略高于线粒体基因组全序列(70.8%和65.3%)和卵白质源代码基因(69.8%和63.5%)。这种局面在其余已通讯的六足众生线粒体基因组全序列中同样生存,这大概表示在六足众生中,高A+T含量并不是A+T充分区的需要特性。9.       在斑翅草螽、优美蝈螽和朔方棘螽线粒体基因组A+T充分区的J链和N链上均有贯串的T簇散布,一致的构造在果蝇等全反常类虫豸中被觉得是线粒体基因组复制的调节和控制旗号。10.   经过对30种直翅目虫豸线粒体谱系基因组学接洽扶助将直翅目分别为螽亚目和蝗亚目两支。螽亚目里面分支的拓扑构造比拟宁静,分为三个分支:即由8种螽蟖总科虫豸产生的第一分支,由3种蛐蛐儿总科虫豸产生的第二小支,和由东方蛞蝼独立产生的第三小支,三个小支间的联系为(螽蟖总科,(蛐蛐儿总科,蛞蝼总科))。螽蟖总科里面的分支情势也基础不妨决定,分支联系为((螽蟖科,硕螽科),(草螽科,露螽科))。蝗亚目分支里面分别较大,然而有以次几点基础不妨决定:1)瘤锥蝗科、锥头蝗科和蚤蝼总科聚为一个与其它蝗总科虫豸平行的单系支。2)网翅蝗科、剑角蝗科、斑翅蝗科和斑腿蝗科的单系性都不被扶助。3)网翅蝗科和剑角蝗科虫豸瓜代聚为一支,并产生较大的分支。

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