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舆论摘要:华夏斑腿蝗科局部品种线粒体ND2基因及其相邻tRNAs基因的分子进化与体例学接洽

免费论文3年前 (2022-04-23)舆论摘要50

  斑腿蝗科(Catantopidae)从属于直翅目蝗亚目蝗总科(Orthoptera:Caelifera:Acridoidea),是蝗总科中最大的科。我国已知l6亚科93属,个中散布于东瀛区的居多,古北区品种较少。个中中华稻蝗、阿曼黄脊蝗、棉蝗、短星翅蝗等品种为农业消费上的重重要虫,对它们的体例分门别类学接洽不只具备表面意旨,同声在蚂蚱防疫的农业植物保护试验中也具备较为要害的运用价格。但是,暂时国表里对斑腿蝗科虫豸的分子体例学接洽还特殊少。本接洽以ND2及其相邻tRNAs基因序名列分子标志,对斑腿蝗科8亚科12属19种虫豸体例发育联系举行重修,为决定它们之间的体例学接洽供给分子证明。   线粒体ND2基因进化速度对立较快。连年来,ND2基因在鸟类、鱼类和两栖类众生的分子体例学接洽中获得了普遍的运用,充溢表露出其杰出的分子标志个性。但是在虫豸中,只是局部基因片断被用来小批分子体例发育接洽。本接洽沿用PCR产品克隆测序法测定了l9种斑腿蝗与两种癞蝗ND2基因全基因序列及4个相邻tRNAs序列(tRNA-Met,tRNA-Trp,tRNA-Cys and tRNA-Tyr)共l251bp。运用ClustalX举行序列比对,并按照tRNA二级构造比较对截止举行细工矫正。去除不许精确比对的tRNA TψC环区序列与非源代码序列,将序列分别为ND2数据集与tRNAs数据集。沿用MEGA2.1举行序列构成统计。在PAUP*4.Ob10(PPC)中对各分别数据集与共同数据集的体例发育旗号举行检查以及分别数据集投合性领会,并以MP、NJ、ML三种树立本领举行体例发育联系重修。在MrBayes V3.0中沿用贝叶斯推广法举行体例发育联系重修。结果运用百般检验和测定本领对树分支相信度举行检查,并对各别树拓扑构造举行比拟。获得论断如次:   1.ND2基因除紫胫长夹蝗Choroedocus violaceiepes为1026bp外,其他种为1023bp。两个外群种在ND2序列与tRNA-Trp之间有两个间隙碱基(AC),其他百般的ND2序列和tRNA-Trp序列有两个碱基的臃肿(AA)。tRNAs环区插入/缺点和失误变异较大,比对序列长193bp。tRNA-Trp与tRNA-Cys互补序列之间有8bp的臃肿。tRNA-Cys互补序列与tRNA-Tyr互补序列之间含有一段间隙序列,长度4~27bp不等。   2.疹蝗属与胸斑蝗属ND2基因的开始暗号子为GTG,而其余品种的开始暗号子为罕见的ATG开始暗号子。一切斑腿蝗科虫豸的ND2基因中断暗号子为TAA,而两种癞蝗的中断暗号子为TAG。   3.在本接洽中创造了特殊高的A+T含量(ND2基由于73.1%,tRNA基由于80.5%)。ND2基因变异率高(可变位点占57.9%),进化速度快。   4.碱基替代饱和领会表露ND2第一、第三暗号子的变换和tRNAs环区的变换均到达饱和,其他位点的变换和颠换都未到达饱和。随机树长散布检查和PTP检查都表露三个数据集均包括很强的体例发育旗号,并非随机数据。对分隔数据集普遍性检查的截止未表露明显导电性(

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